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La raíz ped, que forma parte del prefijo pedo- y el sufijo -pedia, procede del griego παιδος (paidós) y forma parte de palabras que aluden a los niños, la infancia y la educación:

pedagogía, logopeda, pedofilia, pediatra, enciclopedia, pedarquía

Como en el resto de las raíces griegas, se adopta a través del latín, de modo que el griego ai pasa al latín ae y de este pasa al castellano e. Excepcionalmente, la RAE prefiere paidofilia a pedofilia.

Hay una raíz idéntica que alude al suelo y los pies:

pedología, pedúnculo, pedicura, pediluvio, pedífero, pediforme, podómetro

Pueden venir del latin pedis, pes (‘pie’) o del griego pedión (‘llanura’, de modo que pediófilo es ‘amante de las llanuras’).

No es de la misma raíz pediculo-, que se refiere a los piojos.